simbiolab

مسابقه هیجان‌انگیز SIMBIOLAB

مسابقه شرکت SIMBIOLAB

 

مسابقه هیجان‌انگیز شرکت SIMBIOLAB

کریسپر یک فناوری ویرایش ژنتیکی است که امکان اصلاح یا تغییر دقیق در ساختار ژنوم ارائه می‌دهد. این فناوری از سیستم دفاعی باکتری‌ها در برابر ویروس‌ها الهام گرفته است و اجازه می‌دهد تا توالی‌های ژنتیکی مشخصی در یک سلول یا سازمان زنده، مانند انسان، تغییر یابند.

کریسپر به عنوان یک ابزار ویرایش ژنتیکی، توسعه در زمینه درمان بیماری‌ها و بهبود صفات ژنتیکی فردی را امکان‌پذیر ساخته است.

فرایند ویرایش ژنی مبتنی بر کریسپر شامل چند حیطه متنوع می‌باشد:

  • ایجاد شکست‌های دو رشته‌ای با استفاده از Cas9

رمزگشایی اهمیت ژن‌های مختلف در فیزیولوژی و فیزیوپاتولوژی بیماری‌های مختلف:

 

ایجاد شکست‌های دو رشته‌ای هدفمند در توالی هدف ژنومی این فرایند بیشتر در فرایندهای پژوهشی به منظور بررسی اثرات غیر فعال سازی یک ژن مورد استفاده می‌گیرد.

در این تکنولوژی جزء پروتئینی سیستم کریسپر یعنی Cas9 با کمک و راهبری جزء RNA این سیستم که sgRNA نامیده می‌شود، به‌طور اختصاصی توالی ژن هدف را شناسایی نموده و در آن شکست دو رشته‌ای ایجاد می‌کند.

به دنبال ترمیم این شکست‌های دو رشته‌ای جهش‌های حذف و اضافه نوکلئوتید (indel Mutation) به وجود می‌آید. در نتیجه چهارچوب خوانش پروتئین محصول ژن مختل شده و ژن مربوطه غیر فعال می‌شود.

اثرات این غیر فعال سازی با استفاده از تکنیک‌های مختلف ملکولی و سلولی قابل بررسی خواهد بود.

شایع‌ترین ابزارهای مورد استفاده در این فرایند پلاسمیدهای pX458 و pX459 می‌باشند که به ترتیب دارای مارکر مقاومت به نئومایسین و  مارکر فلورسانس GFP می‌باشند. به منظور وارد کردن توالی sgRNA به داخل این پلاسمیدها آنزیمهای محدودکننده بسیار اختصاصی و گران قیمت BbsI مورد نیاز هست.

 

با توجه به هزینه بالای تأمین این پلاسمیدها و همچنین آنزیم‌ مورد استفاده در این فرایند شرکت SIMBIOLAB خدمات کلونینگ و تولید این پلاسمیدها را در قالب خدمات تولید پلاسمیدهای سفارشی بیان کننده sgRNA،  با قیمت و سرعت استثنایی به پژوهشگران محترم این حیطه ارائه می‌دهد. به منظور اطلاعات بیشتر در این زمینه با تیم فروش شرکت تماس بگیرید.

 

کیت‌های مهندسی ژنتیک SIMBIOLAB

 

  • ایجاد شکست‌های تک رشته‌ای دوبل با استفاده از pX335

ارتقاء دقت و کاهش off-Target

مهم‌ترین دغدغه در فرایند هدف‌گیری ژن‌ها با استفاده از سیستم کریسپر، شناسایی توالی‌های مشابه توالی هدف و ایجاد جهش در این مناطق (off-Target) ‌باشد.

به منظور به حداقل رساندن این احتمال می‌توان از سیستم نیکاز (Nickase) استفاده کرد. در این استراتژی از پروتئین Cas9 جهش یافته استفاده  می‌شود که قابلیت ایجاد جهش‌های دو رشته‌ای را از دست داده و تنها در یک رشته از DNA برش ایجاد می‌کند.

با طراحی 2 ملکول sgRNA هدف گیرنده رشته‌های مکمل در مجاورت یکدیگر می‌توان با واسطه ایجاد دو  شکست تک رشته در مجاورت یکدیگر، در نهایت منجر به ایجاد شکست دو رشته‌ای شد. چنین فرایندی منجر به افزایش قابل توجه دقت سیستم کریسپر می‌شود.

شرکت SIMBIOLAB این افتخار را دارد که خدمات تولید این ابزارها را نیز به محققین این رشته ارائه دهد. علاوه بر این پلاسمیدهای خطی شده با استفاده از آنزیم BbsI نیز به عنوان محصولات شرکت در دسترس محققین است.

مشاهده انواع پلاسمیدهای خطی 

  • اصلاح هدفمند و دقیق جهش تک نوکلئوتیدی و جهش‌های کوچک با استفاده از سیستم Prime-Editing

 

برای شرکت در کارگاه Prime Editing با سخنرانی دکتر مجید مجرد مدیر عامل شرکت دانش بنیان simbiolab در سایت کنگره بیوتکنولوژی ثبت نام کنید.

 

سیستم Prime Editing  آغاز پایان عصر بیماری‌های ژنتیکی!

علی رغم کاربردهای بسیار با ارزش کریسپر نسل اول عدم توانایی این سیستم در تصحیح جهش‌های مختلف هدفمند سد بزرگی در مسیر درمان بیماری‌های ژنتیکی بود که با ابداع سیستم Prime Editing از سر راه تحقیقات ژن درمانی برداشته شده است.

 

در این سیستم همزمان با ایجاد یک برش تک رشته‌ای در محل اختصاصی با واسطه سیستم nCas9\ (نیکاز) با واسطه طراحی یک الگوی RNA و آنزیم RT متصل شده به پروتئین Cas و بازسازی رشته DNA دارای باز حاوی جهش مورد نظر، می ‌توان جهش ایجاد شده را اصلاح و یا حتی جهش مورد نظر را القا کرد!

این روش امیدهای فراوانی برای درمان بیماری‌های ژنتیکی و همچنین مطالعات بررسی عملکرد واریانت‌های مشخص ژنتیکی ایجاد کرده است.

طراحی و تولید جزء RNA سیستم Prime Editing به مراتب پیچیده تر و گران تر از تولید sgRNA کلاسیک می‌باشد. علاوه بر این فرایند ساخت قطعات pegRNA و اندازه بلند این ملکول فرایند کلون سازی این قطعات به داخل پلاسمیدهای مورد استفاده بسیار چالش برانگیز می کند.

 

طراحی و تولید این ابزار در شرکت راه اندازی و بهینه سازی شده است و محققین در طول کمتر از یک ماه قادر به استفاده از این ابزارها در مطالعات خود خواهند بود.

 

برای شرکت در مسابقه، فرم زیر را تکمیل کرده و به این سؤالات پاسخ دهید.

 

مسابقه Simiolab

نام(ضروری)

سوالات آزمون

1. شایع‌ترین پلاسمیدهای مورد استفاده در ایجاد شکست‌های دو رشته‌ای با استفاده از Cas9 کدام هستند؟
۲- به منظور وارد کردن توالی sgRNA به داخل پلاسمیدهای مورد استفاده در فرایند کریسپر به کدام آنزیم محدودکننده نیاز است؟
۳- مهم‌ترین دغدغه در فرایند هدف گیری ژن‌ها با استفاده از سیستم کریسپر چیست؟
۴- در سیستم کریسپر، Cas9 چه ماهیتی دارد؟
۵- پلاسمید pX458 دارای مارکر مقاومت به کدام آنتی‌بیوتیک است؟
۶- ایجاد شکست‌های تک رشته‌ای با کمک کدام پلاسمید انجام می‌شود؟
۷- جهش تک نوکلئوتیدی و جهش‌های کوچک با کدام مورد با نهایت دقت، اصلاح می‌شوند؟
۸- تفاوت بین Cas9 جداشده از باکتری‌های مختلف در کدام خصوصیت آن‌ها است؟
۹- بیشترین بازدهی ایجاد جهش در کدام حالت زیر به دست می‌آید؟
۱۰- توالی sgRNA در روش‌های مبتنی بر پلاسمید به چه صورت تولید می‌شود؟
۱۱- بهترین ابزار پیشنهادی برای مقابله با ویروس HTLV1 کدام است؟
۱۲- از نظر شما بهترین ابزار قابل استفاده برای ورود سیستم کریسپر به داخل باکتری‌های هدف کدام است؟
۱۳- بزرگترین خطر متصور برای تکنولوژی کریسپر کدام است؟
۱۴- وجه تمایز CRISPOR از بقیه سایت‌هایی طراحی sgRNA چیست؟
۱۵- عدد CFD در سایت CRISPOR نشان‌دهنده چیشت؟

 

بازگشت به لیست

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *